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フィラミンA

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
FLNA
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2AAV, 2BP3, 2BRQ, 2J3S, 2JF1, 2K3T, 2K7P, 2MTP, 2W0P, 2WFN, 3CNK, 3HOC, 3HOP, 3HOR, 3ISW, 3RGH, 4M9P, 4P3W

識別子
記号FLNA, ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, filamin A, FGS2
外部IDOMIM: 300017 MGI: 95556 HomoloGene: 1119 GeneCards: FLNA
遺伝子の位置 (ヒト)
X染色体
染色体X染色体[1]
X染色体
FLNA遺伝子の位置
FLNA遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点154,348,524 bp[1]
終点154,374,634 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
X染色体 (マウス)
染色体X染色体 (マウス)[2]
X染色体 (マウス)
FLNA遺伝子の位置
FLNA遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点73,267,067 bp[2]
終点73,293,426 bp[2]
RNA発現パターン




さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 protein homodimerization activity
protein-containing complex binding
転写因子結合
mu-type opioid receptor binding
シグナルトランスデューサー活性
actin filament binding
small GTPase binding
キナーゼ結合
actin binding
SMAD binding
Fc-gamma receptor I complex binding
G protein-coupled receptor binding
GTPase binding
RNA結合
potassium channel regulator activity
transmembrane transporter binding
cadherin binding
血漿タンパク結合
細胞の構成要素 細胞質

焦点接着
cortical cytoskeleton
細胞膜
Myb complex
dendritic shaft
細胞外領域
soma
細胞皮質
核小体
マイクロフィラメント
actin cytoskeleton
perinuclear region of cytoplasm
エキソソーム
細胞骨格
細胞核
尖端樹状突起
filamentous actin
細胞外マトリックス
cell-cell junction
細胞質基質
Z discdkac
生物学的プロセス actin cytoskeleton reorganization
negative regulation of transcription by RNA polymerase I
negative regulation of protein catabolic process
タンパク質局在化の確立
タンパク質の安定化
platelet degranulation
mRNA transcription by RNA polymerase II
negative regulation of apoptotic process
receptor clustering
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
cytoplasmic sequestering of protein
platelet activation
mitotic spindle assembly
positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading
protein localization to cell surface
cell projection organization
adenylate cyclase-inhibiting dopamine receptor signaling pathway
actin crosslink formation
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
positive regulation of integrin-mediated signaling pathway
platelet aggregation
cell junction assembly
regulation of cell migration
wound healing, spreading of cells
semaphorin-plexin signaling pathway
formation of radial glial scaffolds
大脳皮質発生
cilium assembly
protein localization to plasma membrane
positive regulation of potassium ion transmembrane transport
regulation of membrane repolarization during atrial cardiac muscle cell action potential
regulation of membrane repolarization during cardiac muscle cell action potential
positive regulation of neural precursor cell proliferation
positive regulation of neuron migration
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001110556
NM_001456

NM_001290421
NM_010227

RefSeq
(タンパク質)

NP_001104026
NP_001447

NP_001277350
NP_034357
NP_001390993

場所
(UCSC)
Chr X: 154.35 – 154.37 MbChr X: 73.27 – 73.29 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

フィラミンA(filamin A)は、ヒトではFLNA遺伝子によってコードされているタンパク質である[5][6]

機能

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フィラミンは約280 kDaのアクチン結合タンパク質であり、細胞皮質においてアクチンフィラメントを架橋して直交するネットワークを形成し、またアクチン骨格の膜タンパク質への係留にも関与している。細胞骨格の再編成は細胞の形状や遊走の調節に中心的役割を果たしている。FLNA遺伝子にコードされるフィラミンAは幅広く発現しているフィラミンであり、インテグリン膜貫通受容体複合体やセカンドメッセンジャーと相互作用してアクチン骨格の再編成を調節している[7]FLNA遺伝子には疾患の原因となる変異が少なくとも31種類発見されている[8]

構造

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フィラミンAには、N末端のアクチン結合ドメイン、24個のIg様リピート、2つのヒンジ領域から構成される[9][10]

相互作用

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フィラミンAは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

RNA編集

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FLNApre-mRNAには1か所、アデノシンからイノシンへのRNA編集部位が存在する。この編集部位は最終的なタンパク質の2341番目のアミノ酸に相当する。編集部位でのアデノシンの特異的な脱アミノ化によって、コドングルタミン(Q)からアルギニン(R)へ変化する。編集領域は約200ヌクレオチド下流に位置する相補性配列(ECS)と32塩基対の二本鎖を形成することが予測されている。このECSはイントロン配列中に存在する[25]。このQ/R部位の編集にはADAR1ADAR2英語版の双方が関与している可能性が高い。マウスでは、Adar1のノックアウトではQ/R部位の編集に影響はみられず、Adar2のノックアウトによってわずかに減少する。Adar1とAdar2のダブルノックアウトでは編集はみられなくなる[26]

編集を受けるアデノシンは22個のIg様リピートをコードする領域に位置している。この領域は、インテグリンβ鎖結合ドメインであり[27]RAC1結合ドメインでもある[20]。アミノ酸の変化は結合ドメインの静電ポテンシャルに影響を及ぼし[25]、多くのタンパク質への結合に影響を及ぼしている可能性が高い[28]FLNAの編集部位はGRIA2(GluR2)のR/G部位と同様にスプライス部位から2ヌクレオチドの位置にあり、どちらの転写産物も編集部位周辺のヌクレオチドは7/8が同一である。GRIA2のR/G部位の編集はスプライシングに影響を及ぼすと考えられており、両者の配列や編集部位の類似性はFLNAの編集もスプライシングを調節している可能性があることを意味している。GRIA2に関するin vitroでの実験では、ADAR2の存在によってスプライシングの阻害が引き起こされることが示されている[29]FLNAに関するESTデータの解析では、最終エクソンの編集とその後のイントロン配列の保持との関連が示されている[25]

DNA修復

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フィラミンAとBRCA1タンパク質のとの相互作用は、DNA修復過程の初期段階の効果的調節に必要である[30]。フィラミンAは相同組換え非相同末端結合といったDNA修復過程の制御への関与が示唆されている[30]

出典

[編集]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196924 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031328 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Actin-binding protein (ABP-280) filamin gene (FLN) maps telomeric to the color vision locus (R/GCP) and centromeric to G6PD in Xq28”. Genomics 17 (2): 496–8. (October 1993). doi:10.1006/geno.1993.1354. PMID 8406501. 
  6. ^ “Localized mutations in the gene encoding the cytoskeletal protein filamin A cause diverse malformations in humans”. Nat Genet 33 (4): 487–91. (March 2003). doi:10.1038/ng1119. PMID 12612583. 
  7. ^ Entrez Gene: FLNA filamin A, alpha (actin binding protein 280)”. 2024年12月30日閲覧。
  8. ^ “Refinement of evolutionary medicine predictions based on clinical evidence for the manifestations of Mendelian diseases”. Scientific Reports 9 (1): 18577. (December 2019). Bibcode2019NatSR...918577S. doi:10.1038/s41598-019-54976-4. PMC 6901466. PMID 31819097. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6901466/. 
  9. ^ “Relations between the electrical potential, pH gradient, proton flux and phosphorylation in the photosynthetic membrane”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 423 (2): 141–63. (February 1976). doi:10.1016/0005-2728(76)90174-2. PMID 2316. 
  10. ^ P21333 (FLNA_HUMAN): Filamin-A”. UniProt. 2-24-12-30閲覧。
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  15. ^ “Interaction of the calcium-sensing receptor and filamin, a potential scaffolding protein”. J. Biol. Chem. 276 (37): 34871–9. (September 2001). doi:10.1074/jbc.M100775200. PMID 11390379. 
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関連文献

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