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SMAD3

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
Smad3から転送)
SMAD3
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2LB2, 1MHD, 1MJS, 1MK2, 1OZJ, 1U7F, 2LAJ, 5OD6, 5ODG

識別子
記号SMAD3, HSPC193, HsT17436, JV15-2, LDS1C, LDS3, MADH3, SMAD family member 3
外部IDOMIM: 603109 MGI: 1201674 HomoloGene: 55937 GeneCards: SMAD3
遺伝子の位置 (ヒト)
15番染色体 (ヒト)
染色体15番染色体 (ヒト)[1]
15番染色体 (ヒト)
SMAD3遺伝子の位置
SMAD3遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点67,063,763 bp[1]
終点67,195,173 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
9番染色体 (マウス)
染色体9番染色体 (マウス)[2]
9番染色体 (マウス)
SMAD3遺伝子の位置
SMAD3遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点63,554,049 bp[2]
終点63,665,276 bp[2]
RNA発現パターン




さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 phosphatase binding
DNA-binding transcription factor activity
R-SMAD binding
co-SMAD binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
転写因子結合
金属イオン結合
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
酵素結合
transforming growth factor beta receptor binding
protein homodimerization activity
collagen binding
zinc ion binding
クロマチン結合
cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
血漿タンパク結合
二本鎖DNA結合
プロテインキナーゼ結合
sequence-specific DNA binding
DNA結合
bHLH transcription factor binding
ubiquitin binding
identical protein binding
protein heterodimerization activity
chromatin DNA binding
ubiquitin protein ligase binding
beta-catenin binding
RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
DEAD/H-box RNA helicase binding
mineralocorticoid receptor binding
glucocorticoid receptor binding
primary miRNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
SMAD binding
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription coregulator activity
細胞の構成要素 細胞質
細胞核
heteromeric SMAD protein complex
SMAD protein complex
transcription regulator complex
receptor complex
細胞膜
細胞内
核質
核内膜
細胞質基質
高分子複合体
生物学的プロセス 体節形成
骨格系発生
ureteric bud development
内胚葉の発生
regulation of transforming growth factor beta2 production
embryonic pattern specification
regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of osteoblast differentiation
heart looping
positive regulation of chondrocyte differentiation
positive regulation of alkaline phosphatase activity
positive regulation of interleukin-1 beta production
pericardium development
regulation of binding
negative regulation of wound healing
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
negative regulation of inflammatory response
positive regulation of positive chemotaxis
negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of fat cell differentiation
cell-cell junction organization
regulation of transcription, DNA-templated
extrinsic apoptotic signaling pathway
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
signal transduction involved in regulation of gene expression
in utero embryonic development
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
nodal signaling pathway
positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of cell growth
regulation of immune response
positive regulation of transforming growth factor beta3 production
T cell activation
activin receptor signaling pathway
regulation of striated muscle tissue development
embryonic foregut morphogenesis
positive regulation of bone mineralization
傷の治癒
negative regulation of apoptotic process
positive regulation of extracellular matrix assembly
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
mitigation of host defenses by virus
甲状腺発生
developmental growth
lens fiber cell differentiation
原腸形成
免疫応答
osteoblast differentiation
primary miRNA processing
negative regulation of osteoblast proliferation
osteoblast development
embryonic cranial skeleton morphogenesis
分化転換
paraxial mesoderm morphogenesis
低酸素症への反応
positive regulation of cell migration
mesoderm formation
regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
positive regulation of gene expression
免疫系発生
positive regulation of focal adhesion assembly
肝臓発生
regulation of epithelial cell proliferation
positive regulation of stress fiber assembly
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of mitotic cell cycle
negative regulation of cytosolic calcium ion concentration
canonical Wnt signaling pathway
タンパク質の安定化
transcription, DNA-templated
negative regulation of protein catabolic process
protein deubiquitination
positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
negative regulation of lung blood pressure
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress
cellular response to transforming growth factor beta stimulus
cellular response to cytokine stimulus
positive regulation of protein import into nucleus
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
SMAD protein signal transduction
positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
SMAD protein complex assembly
副腎発生
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001145102
NM_001145103
NM_001145104
NM_005902

NM_016769

RefSeq
(タンパク質)

NP_001138574
NP_001138575
NP_001138576
NP_005893

NP_058049

場所
(UCSC)
Chr 15: 67.06 – 67.2 MbChr 15: 63.55 – 63.67 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

SMAD3(SMAD family member 3)は、ヒトではSMAD3遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6]

SMAD3はSMADファミリーのメンバーである。SMAD3はTGF-βスーパーファミリーサイトカインによって開始されたシグナルを媒介し、細胞増殖、分化細胞死を調節する[7][8]TGF-βシグナル伝達経路英語版に必要不可欠な役割を果たし、がんの発生過程における腫瘍の成長と関係している。

遺伝子

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ヒトのSMAD3遺伝子は15番染色体英語版のバンド15q22.33に位置する。この遺伝子は131,433塩基対の長さで9個のエクソンから構成される[9]。この遺伝子はもともとキイロショウジョウバエDrosophila melanogasterで発見された遺伝子のヒトホモログの1つである。

SMAD3の発現はMAPKMAPK/ERK経路英語版)、特にMEK1の活性と関連している[10]上皮細胞平滑筋細胞では、MEK1の活性の阻害はSMAD3の発現も阻害することが示されている。これら2つの細胞種はTGF-β1に対する応答性が高い[10]

タンパク質

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SMAD3は48,080 Daポリペプチドであり、SMADファミリーに属する。SMAD3は、TGF-β受容体が位置する膜へSARA英語版(SMAD anchor for receptor activation)によってリクルートされる。TGF-β(Nodal英語版アクチビンミオスタチン英語版や他のファミリーメンバーも含む)に対する受容体は膜結合型セリン/スレオニンキナーゼであり、SMAD2英語版とSMAD3を選択的にリン酸化して活性化する。

SMAD3のC末端がリン酸化されると、SARAから解離してSMAD4と複合体を形成する。多くの標的遺伝子の転写調節にはこの複合体形成が必要である[11]。2分子のSMAD3と1分子のSMAD4からなる複合体はMH1ドメインを介した相互作用によってDNAへ直接結合する。これらの複合体は、TGF-βの文脈依存的な作用を決定する系統決定転写因子(lineage-determining transcription factor、LDTF)によって、ゲノム中の結合部位へリクルートされる。プロモーターエンハンサーに位置する結合部位は、SMAD結合エレメント(SMAD-binding element、SBE)と呼ばれる。これらの部位はCAG(AC)|(CC)とGGC(GC)|(CG)のコンセンサス配列を含み、後者は5GCモチーフとしても知られている[12]。5GCモチーフはゲノム中のSMAD結合領域にクラスターとして多く存在する。これらのクラスターにはCAG(AC)|(CC)部位も含まれることがある。SMAD3/SMAD4複合体は、TGAGTCAGという配列モチーフを持つTPA応答性遺伝子プロモーターエレメント(TPA-responsive gene promoter element)にも結合する[13]

構造

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SMAD3はMH1ドメイン、MH2ドメイン、そして両者を連結するリンカー領域よって構成される[14]

MH1ドメイン

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GTCT DNAに結合したSMAD3のMH1ドメインのX線結晶構造によって、そのフォールドの特徴が明らかにされている。MH1ドメインの構造は4本のαヘリックスと3組の逆平行βヘアピンから構成され、βヘアピンの1つはDNAとの相互作用に利用されている。また、結合したZn2+の存在も明らかにされており、His126、Cys64、Cys109、Cys121残基が配位している[11][12]。MH1ドメインの主要なDNA結合領域はβ1ストランドに続くループ、そしてβ2-β3ヘアピンから構成される。5GCモチーフの1つであるGGCGCモチーフとの複合体中では、5つの塩基対(GGCGC/GCGCC)を含む二本鎖DNAの主溝の凹面に対し、DNA結合ヘアピンの凸面が潜り込むように結合している。さらに、全てのR-SMAD英語版とSMAD4で厳密に保存された3つの残基(SMAD3ではβ2のArg74、Gln76とβ3のLys81)が二本鎖DNAとの特異的な水素結合ネットワークに関与している。タンパク質-DNA相互作用面では、強固に結合したいくつかの水分子が相互作用の安定化に寄与していることも発見されている。SMAD3とGGCGC部位との複合体からは、タンパク質-DNA相互作用面の形状は高度に相補的であり、1つのMH1ドメインが6塩基対のDNAを覆うことが明らかにされている。

MH2ドメイン

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MH2ドメインは、R-SMADと活性化されたTGF-β受容体との相互作用、そしてR-SMADのSer-X-Serモチーフが受容体によってリン酸化された後のSMAD4との相互作用を媒介する。またMH2ドメインは、細胞質への固定因子、DNA結合のコファクター、ヒストン修飾酵素クロマチンリーダー(chromatin reader)、ヌクレオソーム位置決定因子(nucleosome-positioning factor)などが結合するプラットフォームでもある。SMAD3とSMAD4のMH2ドメインの構造が決定されており[15]、MH2の構造は2組の逆平行βストランド(それぞれ6本と5本のストランドから構成される)がβサンドイッチ英語版型に配置され、一方の側には3ヘリックスバンドルが、もう一方の側には大きなループと1つのヘリックスが配置されている。

機能と相互作用

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TGF-β/SMADシグナル伝達経路

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SMAD3は転写調節因子として機能し、TGF-βによって調節される多くの遺伝子のプロモーター領域のTRE(TPA responsive element)に結合する。SMAD3とSMAD4はAP-1/SMAD結合部位においてc-Fosc-Junと複合体を形成することもでき、TGF-β誘導性の転写を調節する[13]。SMAD3を介したTGF-βシグナル伝達によって調節される遺伝子は、分化、成長、細胞死に影響を与える。TGF-β/SMADシグナル伝達経路は、胚性幹細胞の分化を制御する遺伝子の発現に重要な役割を果たすことが示されている[16]。この経路によって発現が調節される発生関連因子には、FGF1英語版NGFWNT11英語版のほか、幹細胞/前駆細胞関連因子であるCD34CXCR4英語版がある[17]多能性の調節因子としてのこの経路の活性には、TRIM33英語版-SMAD2/3クロマチンリーダー複合体が必要である[16]

TGF-β/SMAD3による抑制

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TGF-βは遺伝子をアップレギュレーションする活性の他に、TIE(TGF-β inhibitory element)を持つ標的遺伝子の抑制も誘導する[18][19]。SMAD3はTGF-βによる標的遺伝子の抑制にも重要な役割を果たしており、具体的にはc-Mycの抑制に必要である。c-Mycの転写抑制は、プロモーターのTIE内のRSBE(repressive SMAD binding element)へのSMAD3の直接的な結合に依存している。c-MycのTIEはRSBEとE2F結合部位を持つ複合的なエレメントであり、少なくともSMAD3、SMAD4、E2F4英語版p107英語版が結合することができる[19]

臨床的意義

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疾患

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SMAD3活性の増大は、強皮症への関与が示唆されている。SMAD3は脂肪組織の生理や、肥満2型糖尿病の病理の多面的な調節因子である。SMAD3ノックアウトマウスは脂肪が減少し[20]、耐糖能やインスリン感受性が改善する。SMAD3ノックアウトマウスは、筋萎縮によって運動量が低下するにもかかわらず[21]、高脂肪食による肥満に耐性がある。SMAD3ノックアウトマウスは、3型ロイス・ディーツ症候群英語版動脈瘤-変形性関節症症候群(AOS))の動物モデルとなる。SMAD3の欠損は、iNOSの活性化を介してアンジオテンシンII投与マウスの炎症性大動脈瘤を促進する。マクロファージの枯渇とiNOS活性の阻害は、SMAD3遺伝子変異と関連した大動脈瘤を予防する[22]

がんにおける役割

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SMAD3の役割は分化、成長、細胞死など細胞運命に重要な遺伝子の調節であるため、その活性の変化や抑制によってがんの形成が引き起こされる可能性がが示唆される。いくつかの研究によって、TGF-βシグナル伝達経路は発がんにおいて抑制と促進の双方の機能を果たすことが示されている[23]

SMAD3の転写アクチベーター機能は、EVI-1英語版の活性によって抑制することができる[24]。EVI-1は、造血系細胞の白血病性形質転換に関与している可能性があるジンクフィンガータンパク質である。EVI-1のジンクフィンガードメインはSMAD3と相互作用し、それによってSMAD3の転写活性を抑制する。EVI-1は一部の細胞種において、TGF-βシグナルを抑制してTGF-βの成長阻害効果に対抗することで、成長を促進し分化を阻害すると考えられている[24]

前立腺がん

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前立腺がんにおけるSMAD3の活性は、腫瘍血管形成時の血管新生分子の発現や腫瘍成長時の細胞周期阻害因子の発現の調節と関係している[25][26]。前立腺がんの原発巣や転移巣の成長は、腫瘍の血管新生による十分な血液供給に依存している。前立腺がん細胞株におけるSMAD3の発現レベルを解析した研究では、2つのアンドロゲン非依存性かつアンドロゲン受容体陰性の細胞株(PC-3MM2、DU145)において、SMAD3が高いレベルで発現していることが判明している。SMAD3と血管新生分子の調節との関係の解析からは、前立腺がんにおいてSMAD3が血管新生スイッチの抑制因子として重要な構成要素の1つである可能性が示唆されている[26]。また、PTTG1英語版もSMAD3を介したTGF-βシグナルに影響を与えている。PTTG1は、前立腺がん細胞を含むさまざまながん細胞と関係している。PTTG1の過剰発現はSMAD3の発現の低下を誘導し、SMAD3の阻害を介して前立腺がん細胞の増殖を促進することが研究から示されている[25]

大腸がん

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マウスでは、SMAD3の遺伝子の変異が大腸がんを促進することが示されている[27][28][29]。SMAD3の活性の変化は慢性炎症や体細胞変異と関連しており、慢性大腸炎や大腸がんの発症に寄与している[29]。このマウスでの研究結果は、SMAD3がヒトの大腸がんに関与している可能性を示唆している。SMAD3の影響はヒトの大腸がん細胞株においてもSNPアレイ英語版を用いて解析されている。その結果、SMAD3の転写活性とSMAD2-SMAD4複合体の形成が低下していることが示され、TGF-βシグナル伝達経路におけるこれら3つのタンパク質の重要性と、大腸がんの発生におけるこの経路の影響が明らかにされた[30]

乳がん

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TGF-βによって誘導されるSMAD3の転写調節応答は腫瘍血管新生や上皮間葉転換に対して影響を及ぼし、そのため乳がんの骨転移とも関係している。TGF-β/SMADシグナル伝達経路に作用して主にSMAD2/3複合体に影響を与える多様な分子が同定されており、これらの分子は乳がんの発生と関係している[31]

FOXM1英語版はSMAD3に結合する分子であり、核内でSMAD3/SMAD4複合体の活性化を維持する。FOXM1に関する研究からは、FOXM1はE3ユビキチンリガーゼであるTIF1γ英語版のSMAD3への結合とSMAD4へのモノユビキチン化を防ぎ、SMAD3/SMAD4複合体を安定化することが示唆されている。FOXM1はSMAD3/SMAD4複合体活性に重要な因子であり、SMAD3の転写活性を促進するとともに、SMAD3/SMAD4複合体のターンオーバーにも重要な役割を果たす。FOXM1は浸潤性の高いヒトの乳がん組織で過剰発現していることが判明している。また、TGF-βによる乳がんの浸潤にはFOXM1/SMAD3の相互作用が必要であり、浸潤はSMAD3/SMAD4依存的な転写因子SLUG英語版のアップレギュレーションの結果引き起こされるものであることが明らかにされている[32]

MED15英語版は、TGF-β/SMADシグナル伝達活性を促進するメディエーター英語版分子である。この分子の欠損は、上皮間葉転換の誘導に必要な遺伝子に対するTGF-β/SMADシグナル伝達の活性を減弱する。MED15の作用はSMAD2/3複合体のリン酸化と関係している。MED15のノックダウンによってリン酸化されたSMAD3の量は減少し、転写調節因子としての活性は低下する。MED15は乳がん組織で高発現しており、TGF-βシグナルの亢進と相関している。MED15はTGF-βによる上皮間葉転換を促進することで、乳がん細胞株の転移能を高めていることが研究から示唆されている[33]

腎臓がん

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SMAD3の活性化は腎線維症の発症に関与しており[34]、おそらく骨髄由来線維芽細胞の活性化の誘導によるものである[35]

出典

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  35. ^ “Smad3 signaling activates bone marrow-derived fibroblasts in renal fibrosis”. Laboratory Investigation; A Journal of Technical Methods and Pathology 94 (5): 545–56. (May 2014). doi:10.1038/labinvest.2014.43. PMC 4006302. PMID 24614197. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4006302/. 

関連文献

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外部リンク

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  • Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: P84022 (Mothers against decapentaplegic homolog 3) at the PDBe-KB.