NEAT1
| NEAT1 | |||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||
| 記号 | NEAT1, LINC00084, NCRNA00084, TncRNA, VINC, nuclear paraspeckle assembly transcript 1 (non-protein coding), nuclear paraspeckle assembly transcript 1 | ||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | OMIM: 612769 GeneCards: NEAT1 | ||||||||||||||||||||||||
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| オルソログ | |||||||||||||||||||||||||
| 種 | ヒト | マウス | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
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| Ensembl |
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| UniProt |
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| RefSeq (mRNA) |
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| RefSeq (タンパク質) |
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| 場所 (UCSC) | Chr 11: 65.42 – 65.45 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed検索 | [2] | n/a | |||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||
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Nuclear Enriched Abundant Transcript 1 (NEAT1) は、全長~3.2 kbの核長鎖ノンコーディングRNAである（RIKEN cDNA 2310043N10Rik）。ウイルス誘導性ノンコーディングRNA（VINC）またはMENイプシロンRNAとも呼ばれる。多発性内分泌腺腫症遺伝子座から転写される[3][4][5][6]。
NEAT1の発現はマウス脳において日本脳炎ウイルスおよび狂犬病ウイルスによる感染期に誘導される。NEAT1は数多くの非神経組織および細胞系において構成的に発現している。 NEAT1はパラスペックルと呼ばれる特有の核構造に局在する[7]。NEAT1 RNAはP54nrbまたはNONOと呼ばれるパラスペックルタンパク質と相互作用し、これはパラスペックル形成に必須である。いくかの研究は、NEAT1 RNAがパラスペックルの形成および維持に必須であることを証明している。したがって、このノンコーディングRNAは核パラスペックルにおいて重要な構造的役割を有しているようにみえる[8][9]。
出典
[編集]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000245532 - Ensembl, May 2017
- ^ Human PubMed Reference:
- ^ “Common host genes are activated in mouse brain by Japanese encephalitis and rabies viruses.”. J. Gen. Virol. 84 (Pt 7): 1729–35. (2003). doi:10.1099/vir.0.18826-0. PMID 12810866.
- ^ “Identification and characterization of a virus-inducible non-coding RNA in mouse brain.”. J. Gen. Virol. 87 (Pt 7): 1991–5. (2006). doi:10.1099/vir.0.81768-0. PMID 16760401.
- ^ “A screen for nuclear transcripts identifies two linked noncoding RNAs associated with SC35 splicing domains.”. BMC Genomics 8: 39. (2007). doi:10.1186/1471-2164-8-39. PMC 1800850. PMID 17270048.
- ^ “Entrez Gene: nuclear paraspeckle assembly transcript 1 (non-protein coding)”. 2018年10月10日閲覧。
- ^ “MEN epsilon/beta nuclear-retained non-coding RNAs are up-regulated upon muscle differentiation and are essential components of paraspeckles.”. Genome Res. 19 (3): 347–59. (2009). doi:10.1101/gr.087775.108. PMC 2661813. PMID 19106332.
- ^ “MENepsilon/beta noncoding RNAs are essential for structural integrity of nuclear paraspeckles.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (8): 2525–30. (2009). doi:10.1073/pnas.0807899106. PMC 2650297. PMID 19188602.
- ^ “An architectural role for a nuclear noncoding RNA: NEAT1 RNA is essential for the structure of paraspeckles.”. Mol. Cell 33 (6): 717–26. (2009). doi:10.1016/j.molcel.2009.01.026. PMC 2696186. PMID 19217333.
推薦文献
[編集]- “A transcript map for the 2.8-Mb region containing the multiple endocrine neoplasia type 1 locus.”. Genome Res. 7 (7): 725–35. (1997). doi:10.1101/gr.7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601.
- “Direct visualization of the co-transcriptional assembly of a nuclear body by noncoding RNAs.”. Nat. Cell Biol. 13 (1): 95–101. (2011). doi:10.1038/ncb2140. PMC 3007124. PMID 21170033.
- Peyman JA (2001). “Mammalian expression cloning of two human trophoblast suppressors of major histocompatibility complex genes.”. Am. J. Reprod. Immunol. 45 (6): 382–92. doi:10.1111/j.8755-8920.2001.450603.x. PMID 11458881.
- “Human trophoblast noncoding RNA suppresses CIITA promoter III activity in murine B-lymphocytes.”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (3): 718–24. (2003). doi:10.1016/S0006-291X(03)00028-7. PMID 12565840.
- “Altered nuclear retention of mRNAs containing inverted repeats in human embryonic stem cells: functional role of a nuclear noncoding RNA.”. Mol. Cell 35 (4): 467–78. (2009). doi:10.1016/j.molcel.2009.06.027. PMC 2749223. PMID 19716791.
- Peyman JA (1999). “Repression of major histocompatibility complex genes by a human trophoblast ribonucleic acid.”. Biol. Reprod. 60 (1): 23–31. doi:10.1095/biolreprod60.1.23. PMID 9858482.