SARSコロナウイルス2-ゼータ株

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SARSコロナウイルス2-ゼータ株（サーズコロナウイルスツーゼータかぶ、英語: SARS-CoV-2 Zeta variant、別名: 系統 P.2、系統 B.1.1.28.2、20B/S.484K）は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の原因ウイルスとして知られるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異株である。ブラジルのリオデジャネイロ州で最初に検出された。

世界保健機関 (WHO) は注目すべき変異株 (VOI) に指定し、WHOラベルではゼータ株 (Zeta variant) に分類していた^[1]が、2021年7月にVOIから除外された^[1]^[2]^[3]。

E484K 変異は含まれているが、N501Y及びK417T変異は含まれていない。また、マナウスのガンマ株（系統 P.1）に直接関係することはなく、リオデジャネイロで独立して進化したと考えられる^[4]^[5]。

分類

命名

2020年4月、この系統がブラジルのリオデジャネイロ州で初めて記録され、後に系統 P.2 (lineage P.2) と命名された^[1]^[6]。2021年5月末、WHOは懸念される変異株 (VOC) や注目すべき変異株 (VOI) にギリシャ文字を使用する新しい方針を導入した後、系統 P.2に対しゼータ (ζ:Zeta) のラベルを割り当てた^[1]^[6]。

変異

→「SARSコロナウイルス2の変異株 § ミスセンス変異」も参照

ゼータ株のゲノムには、E484K・D614G・V1176Fの3つのアミノ酸変異があり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれている^[7]。アメリカ疾病予防管理センター (CDC) によると、F565Lはすべてではないが、一部のゼータ変異株配列で検出されている^[8]。

スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異^[7]。

脚注

[脚注の使い方]

^ ^a ^b ^c ^d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2021年10月1日閲覧。
^ 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について（第11報） - 国立感染症研究所 (2021年7⽉17⽇) 、2021年8月15日閲覧。
^ “当センターにおける新型コロナウイルス変異株のスクリーニング検査結果について（2021年10月12日更新）”. 東京都健康安全研究センター. 2021年10月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年10月13日閲覧。
^ “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 28 January 2021閲覧。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”
^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.
^ ^a ^b “新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告”. 厚生労働省. (2021年6月8日) 2021年10月2日閲覧。
^ ^a ^b “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (1 July 2021). 2021年7月5日閲覧。
^ “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 5 July 2021閲覧。

外部リンク

Tracking SARS-CoV-2 variants（英語） - 世界保健機関 (WHO)
Variants of the Virus（英語） - アメリカ疾病予防管理センター (CDC)
Lineage P.2（英語） - Cov-Lineages
Zeta Variant Report（英語） - outbreak.info
新型コロナウイルス感染症について - 厚生労働省
- 新型コロナウイルス感染症に関する報道発表資料変異株 - 厚生労働省
新型コロナウイルス感染症（COVID-19）関連情報 - 国立感染症研究所

[WHO-1] “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2021年10月1日閲覧。

[2] 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について（第11報） - 国立感染症研究所 (2021年7⽉17⽇) 、2021年8月15日閲覧。

[tokyo-eiken-lb_virus-mutation-3] “当センターにおける新型コロナウイルス変異株のスクリーニング検査結果について（2021年10月12日更新）”. 東京都健康安全研究センター. 2021年10月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年10月13日閲覧。

[4] “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 28 January 2021閲覧。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”

[5] Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.

[forth210611-6] “新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告”. 厚生労働省. (2021年6月8日) 2021年10月2日閲覧。

[Stanford1-7] “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (1 July 2021). 2021年7月5日閲覧。

[CDC_variants-8] “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 5 July 2021閲覧。

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分類

命名

変異

脚注

関連項目

外部リンク