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ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
GAR合成酵素から転送)
ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ
大腸菌由来GARS(PDB: 1GSO​)
識別子
EC番号 6.3.4.13
CAS登録番号 9032-01-3
データベース
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG KEGG entry
MetaCyc metabolic pathway
PRIAM profile
PDB構造 RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー AmiGO / QuickGO
検索
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ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ(phosphoribosylamine—glycine ligase)またはグリシンアミドリボヌクレオチドシンテターゼ(glycinamide ribonucleotide synthetase, GARS)は、ホスホリボシルアミン(PRA)とグリシンアミド結合させ、グリシンアミドリボヌクレオチド(GAR)に変換する酵素である。プリン塩基のde novo合成経路の第2段階を担う。

ATP + 5-ホスホ-D-リボシルアミン + グリシン ADP + リン酸 + N1-(5-ホスホ-D-リボシル)グリシンアミド

構造

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原核生物ではpurD遺伝子にコードされる単一機能の酵素である。真核生物でも緑色植物などでは単一機能の酵素であるが、真菌では3段階後の反応を触媒するFGAMシクロリガーゼと融合した2機能酵素になっている。また後生動物ではすぐ後段のGARホルミルトランスフェラーゼおよびFGAMシクロリガーゼと融合した3機能酵素である[1]

反応機構

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反応はグリシンの酸素原子がATPの末端のリン原子を求核攻撃して中間体となり、そのカルボニル基に対してPRAの窒素原子が攻撃することでGARが生成する。基質はPRA、ATP、グリシンの順に酵素に結合し、生成物はリン酸、ADP、GARの順に解離する[2]

参考文献

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  1. ^ Daubner et al. (1985). “A Multifunctional Protein Possessing Glycinamide Ribonucleotide Synthetase, Glycinamide Ribonucleotide Transformylase, and Aminoimidazole Ribonucleotide Synthetase Activities in de Novo Purine Biosynthesis”. Biochemistry 24 (25): 7059, 7061–7062. doi:10.1021/bi00346a006. PMID 4084560. http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/bi00346a006. 
  2. ^ Sampei et al. (2010). “Crystal structures of glycinamide ribonucleotide synthetase, PurD, from thermophilic eubacteria”. J. Biochemistry 148 (4): 429–437. doi:10.1093/jb/mvq088. PMID 20716513. http://jb.oxfordjournals.org/content/148/4/429.full.pdf+html.