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Bak

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
BAK1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

5AJK, 1BXL, 2IMS, 2IMT, 2JBY, 2JCN, 2LP8, 2M5B, 2XPX, 3I1H, 3QBR, 4D2L, 4U2U, 4U2V, 4UF1, 5FMK, 5FMI

識別子
記号BAK1, BAK, BAK-LIKE, BCL2L7, CDN1, BCL2 antagonist/killer 1
外部IDOMIM: 600516 MGI: 1097161 HomoloGene: 917 GeneCards: BAK1
遺伝子の位置 (ヒト)
6番染色体 (ヒト)
染色体6番染色体 (ヒト)[1]
6番染色体 (ヒト)
BAK1遺伝子の位置
BAK1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点33,572,547 bp[1]
終点33,580,293 bp[1]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 transmembrane transporter binding
金属イオン結合
血漿タンパク結合
identical protein binding
protein homodimerization activity
分子機能
熱ショックタンパク質結合
protein heterodimerization activity
シャペロン結合
BH domain binding
細胞の構成要素 integral component of membrane
細胞質基質

ミトコンドリア膜
integral component of mitochondrial outer membrane
細胞内
小胞体
ミトコンドリア
pore complex
ミトコンドリア外膜
BAK complex
生物学的プロセス mitochondrial fusion
leukocyte homeostasis
regulation of apoptotic process
positive regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response
establishment or maintenance of transmembrane electrochemical gradient
limb morphogenesis
positive regulation of calcium ion transport into cytosol
有機環状化合物への反応
B cell apoptotic process
regulation of protein heterodimerization activity
positive regulation of mitochondrial outer membrane permeabilization involved in apoptotic signaling pathway
膣発生
homeostasis of number of cells
cellular response to UV
myeloid cell homeostasis
老化
post-embryonic camera-type eye morphogenesis
B cell homeostasis
thymocyte apoptotic process
endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis
遺伝子発現の負の調節
regulation of cell cycle
regulation of mitochondrial membrane potential
positive regulation of IRE1-mediated unfolded protein response
blood vessel remodeling
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
脳発生
response to fungus
regulation of mitochondrial membrane permeability
cellular response to mechanical stimulus
fibroblast apoptotic process
activation of cysteine-type endopeptidase activity
apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
animal organ regeneration
negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation
positive regulation of proteolysis
positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
apoptotic signaling pathway
negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration
細胞増殖
response to ethanol
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
response to gamma radiation
regulation of protein homodimerization activity
response to UV-C
過酸化水素への反応
膵内分泌発生
release of cytochrome c from mitochondria
B cell negative selection
negative regulation of cell population proliferation
response to mycotoxin
positive regulation of apoptotic process
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
アポトーシス
Unfolded Protein Response
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001188

NM_007523

RefSeq
(タンパク質)

NP_001179

NP_031549

場所
(UCSC)
Chr 6: 33.57 – 33.58 Mbn/a
PubMed検索[2][3]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

Bak(Bcl-2 homologous antagonist/killer)またはBAK1(BCL2 antagonist/killer 1)は、ヒトでは6番染色体英語版BAK1遺伝子にコードされるタンパク質である[4][5]。この遺伝子にコードされるタンパク質は、Bcl-2タンパク質ファミリーに属する。Bcl-2ファミリーのメンバーはオリゴマーまたはヘテロ二量体を形成し、さまざまな細胞活動に関与して抗アポトーシスまたはアポトーシス促進調節因子として作用する。このタンパク質はミトコンドリアに局在し、アポトーシスを誘導する機能を果たす。ミトコンドリアの電位依存性アニオンチャネル(VDAC)と相互作用して開口を促進し、膜電位の喪失とシトクロムcの放出を引き起こす。また、このタンパク質は細胞ストレスへの曝露後にがん抑制因子であるp53と相互作用する[6]

構造

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BAK1はアポトーシス促進性のBcl-2ファミリータンパク質であり、BH1、BH2、BH3、BH4の4つのBcl-2相同ドメイン(BHドメイン)を持つ。これらのドメインは9本のαヘリックスからなり、疎水的なαヘリックスのコアが両親媒性ヘリックスとC末端の膜貫通ヘリックスに囲まれた形状をしている。膜貫通ヘリックスはミトコンドリア外膜(MOM)に固定されている。α2ヘリックスのC末端からα5ヘリックスのN末端にかけての領域とα8ヘリックスの一部の残基によって形成される疎水的な溝は、他の活性型Bcl-2ファミリータンパク質のBH3ドメインを結合する[7]

機能

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BAK1はBcl-2タンパク質ファミリーのメンバーとして、さまざまな細胞活動に関与するアポトーシス促進性調節因子として機能する[6]。健康な哺乳類細胞では、BAK1は主にMOMに局在しているが、アポトーシスシグナルによって刺激されるまでは不活性型に維持される。BAK1は、VDAC2、Mtx2や他の抗アポトーシス性Bcl-2ファミリータンパク質との相互作用によって不活性型に維持される。一方で、VDAC2は新たに合成されたBAK1をミトコンドリアへリクルートし、アポトーシスを実行する機能も持つ[8]。さらに、BAK1はミトコンドリアのVDACの開口を誘導し、ミトコンドリアからのシトクロムcの放出を引き起こすと考えられている[6]。BAK1自身もMOMでMAC英語版と呼ばれるオリゴマーのポアを形成し、ミトコンドリア外膜透過化英語版と呼ばれる過程でアポトーシス促進性因子を漏出させる[9][10][11]

臨床的意義

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一般的に、BAK1のアポトーシス促進機能は過剰発現した場合には神経変性疾患自己免疫疾患に、阻害された場合にはがんに寄与する[8]。例えば、BAK1遺伝子の調節異常はヒトの消化器がんへの関与が示唆されており、一部のがんの発症に関与していることが示唆されている[12][13]。BAK1はHIVの複製経路にも関与しており、ウイルスはT細胞Casp8p41を介してアポトーシスを誘導する。Casp8p41はBAKを活性化して膜を透過化し、細胞死を引き起こす[14]。したがって、BAK1の活性を調節する薬剤はこれらの疾患の治療法として有望である[7]

腹部大動脈瘤英語版(AAA)における遺伝的役割に関する研究では、AAAの疾患組織と非疾患組織の双方において、血液試料中とは異なるBAK1バリアントが存在することが示されている[15][16]。すべての細胞が同じゲノムDNAを持っているという現在のパラダイムに基づけば、このさまざまな組織でのBAK1遺伝子の多様性は、6番染色体上のBAK1遺伝子と20番染色体上に存在するプロセシングを受けたBAK1遺伝子のコピーからの発現によって説明が可能であるかもしれない[17]

相互作用

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BAK1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000030110 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:
  3. ^ Mouse PubMed Reference:
  4. ^ “Induction of apoptosis by the Bcl-2 homologue Bak”. Nature 374 (6524): 733–6. (April 1995). Bibcode1995Natur.374..733C. doi:10.1038/374733a0. PMID 7715730. 
  5. ^ “Modulation of apoptosis by the widely distributed Bcl-2 homologue Bak”. Nature 374 (6524): 736–9. (April 1995). Bibcode1995Natur.374..736K. doi:10.1038/374736a0. PMID 7715731. 
  6. ^ a b c Entrez Gene: BAK1 BCL2-antagonist/killer 1”. 2021年9月27日閲覧。
  7. ^ a b “Building blocks of the apoptotic pore: how Bax and Bak are activated and oligomerize during apoptosis”. Cell Death and Differentiation 21 (2): 196–205. (February 2014). doi:10.1038/cdd.2013.139. PMC 3890949. PMID 24162660. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3890949/. 
  8. ^ a b c d e “Metaxins 1 and 2, two proteins of the mitochondrial protein sorting and assembly machinery, are essential for Bak activation during TNF alpha triggered apoptosis”. Cellular Signalling 26 (9): 1928–34. (September 2014). doi:10.1016/j.cellsig.2014.04.021. PMID 24794530. 
  9. ^ “Deficiency in apoptotic effectors Bax and Bak reveals an autophagic cell death pathway initiated by photodamage to the endoplasmic reticulum”. Autophagy 2 (3): 238–40. (2006). doi:10.4161/auto.2730. PMID 16874066. 
  10. ^ a b c d “Bioactive lipids and the control of Bax pro-apoptotic activity”. Cell Death & Disease 5 (5): e1266. (May 2014). doi:10.1038/cddis.2014.226. PMC 4047880. PMID 24874738. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4047880/. 
  11. ^ “BAK/BAX macropores facilitate mitochondrial herniation and mtDNA efflux during apoptosis”. Science 359 (6378): eaao6047. (February 2018). doi:10.1126/science.aao6047. PMID 29472455. 
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  15. ^ Michel Eduardo Beleza Yamagishi (2009). "A simpler explanation to BAK1 gene variation in Aortic and Blood tissues". arXiv:0909.2321 [q-bio.GN]。
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関連文献

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外部リンク

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