「NAMD」の版間の差分

NAMD
開発元	Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) and the Parallel Programming Laboratory (PPL)
最新版	2.10 / 2014年8月
リポジトリ	gitlab.com/tcbgUIUC/namd;
対応OS	クロスプラットフォーム
対応言語	C++
ライセンス	プロプライエタリソフトウェア
公式サイト	ks.uiuc.edu/Research/namd
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2020年12月23日 (水) 22:22時点における版

NAMD (NAnoscale Molecular Dynamics program)^[1]は、フリーウェアの分子動力学シミュレーションパッケージの一つである。Charm++並列プログラミングモデルを用いて書かれ、並列効率の高さで知られており、大規模な系（数百万の原子）をシミュレートするためにしばしば使われている^[2]。NAMDはイリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のTheoretical and Computational Biophysics Group (TCB) とParallel Programming Laboratory (PPL) との共同研究によって開発されている。

NAMDは1995年にNelsonらによって、可視化コードであるVMDとの連携によってインタラクティブなシミュレーションを可能にする並列分子動力学コードとして導入された。NAMDは、多くの機能を追加し、数千のプロセッサにスケーリングされ、成熟している。2014年10月現在の最新安定版は2.10である。

非商用利用する個人、学術機関、社内ビジネス目的の企業は、コンパイル済みのバイナリとソースコードの両方が無償で入手可能である。

脚注

外部リンク

この項目は、物理学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めています（プロジェクト:物理学／Portal:物理学）。

この項目は、化学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めています（プロジェクト:化学／Portal:化学）。

[1] “Flexibility and Interoperability in a Parallel Molecular Dynamics Code” (postscript)

[2] “NAMD A Parallel Object-Oriented Molecular Dynamics Program” (pdf)

[1]

[2]

@@ 11行目: / 11行目: @@
 | operating_system       = [[クロスプラットフォーム]]
 | genre                  =
-| license                = [[プロプライエタリ・ソフトウェア]]
+| license                = [[プロプライエタリソフトウェア]]
 | source model           = [[オープンソース]]
 | language               = [[C++]]

2020年12月23日 (水) 22:22時点における版

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関連項目

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