核小体形成域
核小体形成領域(かくしょうたいけいせいいき、英語:Nucleolus organizer region, 略称NOR)は、 核小体の形成に重要な染色体領域である。 ヒトでは、NORはアクロセントリック染色体である13、14、15、21、22番染色体の短腕、それぞれRNR1、RNR2、RNR3、RNR4、RNR5遺伝子の部位に位置する[1]。 これらの領域は、5.8S、18S、28SリボソームRNAをコードする[1]。NORは、セントロメアとテロメアの反復するヘテロクロマチンDNA配列の間に挟まれている[1]。これらの領域の正確な配列は、2016年現在のヒト参照ゲノム[1]や、2017年1月6日に発表されたGRCh38.p10には含まれていない[2]。しかし、NORがリボソームDNA(rDNA)遺伝子のタンデムコピーを含むことが知られている[1]。NORの染色体上の近位側および遠位側に隣接する配列として、いくつかの配列が報告されている[3]。ロリスのNORは非常に多様性が高いことが報告されている[4]。他の染色体上にもrDNAに関連するDNA配列があり、核小体形成に関与している可能性がある[5]。
可視化
[編集]バーバラ・マクリントックは、1934年にトウモロコシで「核小体形成体」(nucleolar-organizing body)について初めて記述した[6]。核型分析では、銀染色を用いてNORを同定することができる[7][8]。銀染色によって核小体中にNORを観察することも可能であり、癌性変化を調査するために使用されている[9][10][11]。NORはNORのDNAに結合するタンパク質UBFに対する抗体を用いても観察することができる[1]。
分子生物学
[編集]UBFに加えて、NORはATRXタンパク質、Treacleタンパク質、 サーチュイン7および他のタンパク質にも結合する[1]。UBFは、発現していたrDNAに対する有糸分裂中の「しおり」として見なされており、有糸分裂後すぐに転写を再開することを可能にする[1]。NORの遠位近接接合部(distal flanking junction、DJ)は、核小体の周縁部と会合することが示されている[3]。大腸菌のrDNAオペロンも、真核生物の核小体と同様に、互いに近接して集合することがわかっている[12]。
脚注
[編集]- ^ a b c d e f g h “Nucleolar organizer regions: genomic 'dark matter' requiring illumination”. Genes & Development 30 (14): 1598–610. (2016). doi:10.1101/gad.283838.116. PMC 4973289. PMID 27474438 .
- ^ anon. “Human Genome Overview”. ncbi.nlm.nih.gov/. Genome Reference Consortium. 17 June 2017閲覧。
- ^ a b “The shared genomic architecture of human nucleolar organizer regions”. Genome Research 23 (12): 2003–12. (2013). doi:10.1101/gr.157941.113. PMC 3847771. PMID 23990606 .
- ^ “Hypervariability of Nucleolus Organizer Regions in Bengal Slow Lorises, Nycticebus bengalensis (Primates, Lorisidae)”. Cytogenetic and Genome Research 149 (4): 267–273. (2016). doi:10.1159/000449145. PMID 27648559.
- ^ “Non-canonical ribosomal DNA segments in the human genome, and nucleoli functioning”. Gene 572 (2): 237–42. (2015). doi:10.1016/j.gene.2015.07.019. PMID 26164756.
- ^ “The relation of a particular chromosomal element to the development of the nucleoli in Zea mays”. Zeitschrift für Zellforschung und Mikroskopische Anatomie 21 (2): 294–328. (1934). doi:10.1007/BF00374060.
- ^ “An improved technique for selective silver staining of nucleolar organizer regions in human chromosomes”. Human Genetics 34 (2): 199–206. (October 1976). doi:10.1007/bf00278889. PMID 63440.
- ^ “Combination of silver and fluorescent staining for metaphase chromosomes”. American Journal of Human Genetics 30 (1): 76–9. (January 1978). PMC 1685453. PMID 74950 .
- ^ “Fractal analysis and the diagnostic usefulness of silver staining nucleolar organizer regions in prostate adenocarcinoma”. Analytical Cellular Pathology (Amsterdam) 2015: 250265. (2015). doi:10.1155/2015/250265. PMC 4558419. PMID 26366372 .
- ^ “Prognostic Significance of Two Dimensional AgNOR Evaluation in Local Advanced Rectal Cancer Treated with Chemoradiotherapy”. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention : APJCP 16 (18): 8155–61. (2015). PMID 26745054.
- ^ “Analysis of silver binding nucleolar organizer regions in exfoliative cytology smears of potentially malignant and malignant oral lesions”. Biotechnic & Histochemistry 92 (2): 115–121. (2017). doi:10.1080/10520295.2017.1283055. PMID 28296547.
- ^ “Colocalization of distant chromosomal loci in space in E. coli: a bacterial nucleolus”. Genes & Development 30 (20): 2272–2285. (2016). doi:10.1101/gad.290312.116. PMC 5110994. PMID 27898392 .