D2（ディーツー） 軍事クーデターで独立し建国された軍事都市国家の肝煎りで設立された世界最大の軍産複合体。あらゆる軍需企業やPMC（民間軍事会社）、研究機関、傭兵組織を併合することで傘下に置いている。政府・軍事施設の警備から傭兵派遣による戦闘支援活動や兵站事業、人型機動兵器から自律無人兵器、戦術補助AIの研究開発・運用。中小規模の民間軍事会社の経営コンサルティングなど幅広く軍事ビジネスを展開している。本部は湾部に位置するところに建造された中枢要塞エリア「ドメイン」。
私設警察連合（UPP） 警備安全保障拡大と民間警察事業構想の実現を目的として数社の民間警備会社やセキュリティー企業、民間捜査公社、私立探偵社が統合し設立された連合組織。一般警察が対処しきれない事案に対して活動し捜査や要人警護、警備部隊の要請派遣、セキュリティーインフラ技術の研究開発を行う。世界的に軍事ビジネスを展開し軍備拡張路線を敷く軍産複合体《D2》とは敵対関係である。運営補助としてAI「トローンズ」を稼働させている。
イカルガ・アサルトガード・コーポレーション（IAC） とある私設武装組織の幹部だったイカルガが独立し設立した民間軍事企業。ブルー色を基調とした武装や装甲車両を運用する。側近にはブロンドヘアのクール系美人秘書と軍人サイボーグを従えさせている。主な活動は主要施設の警備活動は勿論、テロリスト組織の鎮圧などを行なっている。
OrcaTec Führer Co.（オルカテック・フューラー社）
海上都市の建造と市政管理を行う市政企業。
ブラックエース（Blackace） 正式名称は「連邦陸軍作戦計画局第５独立機動群試設戦術強襲部隊」。前世紀に連邦政府内に創設されていた反連邦政府組織の鎮圧する特務機関を復活させた部隊。コードネーム「黒の女王蜂」を隊長とした特殊精鋭部隊。
三大理想顕現勢力
独自概念に基づいた「理想」の世界・領域の創造と支配を目的とする３つの巨大組織。
I.D.E.A. 人類最終到達領域とされる「楽園」の再現・実現を目指す者たちによって組織された複合組織。組織内には１２の企業や財団、研究機関が所属している。世界規模の大厄災に対して天空都市『エリュシオン』を建造。
円卓委員会 CEO（最高経営責任者）とIDEAに所属する各組織の代表たち計13名によって構成されている代表取締役会。保守派と革新派とで分派されており、建造したエリュシオンに対する処遇と今後の楽園開発の方針について常に議論が繰り返されている。 箱庭特別行政都市開発機構 通称「箱庭都市機構」。閉鎖的且つ隔離された理想郷を創ることを目的としている特別行政機関。とある計画の為に際して異世界惑星に計9つの《箱庭都市機構特別行政区（H akoniwa M etropolitan S pecial A dministrative D istrict）》を建造した。その後、現存する９つの都市の特性・機能を全て集約・統合した完全独立持続可能都市群「ドミニオン」を建造。
箱庭評議会 箱庭都市機構の最高意思決定議会。諮問機関の一面もあり各地の箱庭都市の運営と動向に目を光られている。ドミニオンを用いた「箱庭計画」という謀略が失敗に終わったことで理事会メンバーは失脚させられ新メンバーによって再構成された。
箱庭私設警察 箱庭首都機構の傘下にある治安維持組織。本機構が保有・管理している施設や土地を専門とする警備や問題事案に対処する役割をもつ。 キヴォトス公社 正式名称は「箱船移民公共企業体」。箱庭首都機構が新たに創設した公共事業体。難民を巨大移民艦艇「箱舟」にて各地の箱庭都市に移民輸送することを目的としている。 アトラシオ 「白き聖域」という意味を持つ。AEPIと箱庭首都機構の闘争で勃発した「箱庭クライシス」の後に出現した第三の理想の世界を体現する者達による組織。白極国家《アルビヲン》に拠点を置いた自治組織。
科学社 アトラシオの下部組織である科学結社。世界中で発生する超常現象によってもたされる「悲劇」に対し超科学の力でこれを根絶することを基本理念に創設された研究組織。本部は巨大な神殿を模しており、内部には天井高く伸びる柱状の大型サーバーユニット「ピラー」が数本も林立している。11人の科学者が最高意思決定権を有しておりそれぞれがマッドサイエンティストである。 白鯨（ハクゲイ） 科学技術専門の投資家・スロウンが所有する蒼白の万能空中移動基地。大質量の船体を浮遊させる重力制御にて飛行能力は勿論のこと水中航行も可能。また光学迷彩機能も搭載されている。船内には艦橋を中心に居住スペースから研究室、和室、巨大浴場やプール、冷凍室、衣装スペース、自動菜園プラントといった豪華客船並みの高水準の空間設備がされている。操縦はメイド型アンドロイドのお姉さん。
黒鴉（クロカラス） 軍需産業専門の投資家・グロウスターが所有する漆黒の超大型万能ステルス機。海中から宇宙まで航行可能であり実質の黒い万能航空機。AIによる完全自動操縦で主人の命令であらゆる環境・戦況に対応できる。
A.T.L.A.S.（アトラス） 「A ttachment T actical L imited A rmor S uits（拡張戦術特殊装甲服）」の略称。「一騎当千（ワンマンアーミー）」として開発された強襲用近接格闘パワードスーツ。黒と赤、紫を基調とした禍々しいデザインとなっている。戦況に応じてあらゆる武装に変形することであらゆる戦闘スタイルを確立することが可能。
《柩（ひつぎ）》シリーズ 巨大軍産複合体「D2」に属する研究機関の次世代兵器嚮導技術委員会委員長で国際テロリスト組織《インベイター》に属する女科学者・ユークリットが確立させた要人守護自律警衛殻システムの総称。
シェイプシフター ユークリットが確立させた要人用全自動警衛殻システム《柩シリーズ》をベースに開発したオネエ口調の人格AIを搭載する全高5.55mの複合可変式自律型戦闘機動体。玉座形態（スタンバイモード）・人型形態（エスコートモード）・双頭竜（ビーストモード）・車両形態（フォーミュラモード）・戦闘機形態（フォートレスモード）の５段階に変形機構をもつ。
XAF-018A スティンガー 特別政令都市の治安維持を目的とする企業「カタフラクト·セキュリティー社」が運用するサソリタイプの強襲型多脚機動兵器。複合兵装のクラブには機関銃とアンカーが搭載。近接格闘から遠距離・中距離まで高機動戦闘を可能とする。
XAF-022S サイファー スティンガーを改良させたクモタイプの制圧型多脚機動兵器。近接格闘武装を廃した代わりに対空防御としてエナジーシールドや追尾型ミサイル門と指揮管制システムと中距離装備や防御面、情報収集能力が向上している。
鎧竜騎（ガイリュウキ） 蒼白人工領域《アトラシオ》の軍が保有するドラゴン騎士型の機動生体兵器。機体のマニピュレータに装備される複合斧槍（デュアルハルヴァート）」。
D.R.E.S.S.（ドレス） Dominated Ries Evolution Suit System。新開発された次世代可変式高機動鎧装の総称。ライドモードの三輪形態からアーチャーモードの人馬形態に装着変形が可能。
スレイプニル 先行試作可変式バイクマシン。グリーン色で塗装されている。後部にセットされている２基のユニットから円盤型のエナジー刃を射出することができる。また変形機構として機体を「着る」ことで人馬型パワードスーツになることが可能。
グラニータ スレイプニルの先行量産型。ブルー色に塗装され中距離重武装でランチャーを標準装備されている。 レオパルド 市街地での戦闘を目的に開発されたスポーツカー型の高速機動戦闘車両。背面右側にレールガンと左側にミサイルポッドを装備。車体正面には牽制用の対人機関銃も装備されている。操縦席と火器管制の助手席で運用される。
DLF：戦闘装甲機竜 連邦理事国のひとつ「帝国」で開発された全長７メートルの恐竜型の機動兵器。強襲型のティラノサウルスモデル、重武装型のトリケラトプスモデル、航空偵察・爆撃型のプテラノドンタイプ、遠距離射撃型のパラサウロロフスモデルの全４タイプが存在する。 アイシテッド 世界中で争いや人災を人為的・間接的に発現させ暗躍していた「首席」という称号を持つ「スガタ」が所有する刀身が黒い反転量子技術対応型双式近接格闘武装。双剣であり連結させることでランス状にすることも可能。使用し斬撃から暗黒物質（ダークマター）状のエネルギー刃を放つ。普段は黒いゴスロリ衣装を着た二人の少女「シュラ」と「ミュラ」に擬態している。
