ブデロビブリオノータ門
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| 分類 | ||||||
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| 学名 | ||||||
| Bdellovibrionota Waite et al. 2021[1][2] (IJSEMリストに記載 2022[3]) | ||||||
| タイプ属 | ||||||
| ブデロビブリオ属 Bdellovibrio Stolp & Starr 1963[4][4] (IJSEMリストに記載 1980[5]) | ||||||
| シノニム | ||||||
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| 綱[8] | ||||||
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ブデロビブリオノータ門（ブデロビブリオノータもん、Bdellovibrionota）は真正細菌の門の一つである。タイプ綱はブデロビブリオ綱（Bdellovibrionia）、タイプ属はブデロビブリオ属（Bdellovibrio）である[1]。
プロテオバクテリア門の大規模な系統発生学的調査により、一部の綱が別の門に属すると扱うことが適当であることが判明して、ほか3つの新門とともにブデロビブリオノータ門は新たに提案された。ブデロビブリオ目細菌は鞭毛による運動を基本に標的に接近して物理的に接触し、ペリプラズムに侵入することで標的を捕食する[9]。一方、同門のオリゴフレクスス目は非捕食性であり[10][6]、捕食形態の進化を示唆する[1]。捕食性が見られないOligoflexus tunisiensisなどのブデロビブリオノータ門細菌は、その遺伝子配列に基づく捕食性予測モデルによって捕食可能であるとの予測結果が得られた[1]。
発生系統
[編集]現在の分類体系はList of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN)[11]とアメリカ国立生物工学情報センター (NCBI)に基づく[8]。
| LTP_12_2021の16S rRNA解析結果[12][13][14] | Genome Taxonomy DatabaseによるGTDB 07-RS207[15][16][17] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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脚注
[編集]- ^ a b c d e f g “Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities”. Int J Syst Evol Microbiol 70 (11): 5972–6016. (2020). doi:10.1099/ijsem.0.004213. PMID 33151140.
- ^ Oren A, Garrity GM (2021). “Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes”. Int J Syst Evol Microbiol 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (02 February 2022). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 71, part 10 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (1). doi:10.1099/ijsem.0.005165.
- ^ a b c d H. Stolp & M. P. Starr (December 1963). “Bdellovibrio bacteriovorus gen. et sp. n., a predatory, ectoparasitic, and bacteriolytic microorganism”. Antonie van Leeuwenhoek 29: 217–248. doi:10.1007/BF02046064. PMID 14068454.
- ^ V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225.
- ^ a b “Oligoflexus tunisiensis gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, filamentous bacterium of a novel proteobacterial lineage, and description of Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. nov. and Oligoflexia classis nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (10): 3353–3359. (2014). doi:10.1099/ijs.0.060798-0. PMC 4179278. PMID 25013226.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 January 2015). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 64, part 10, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_1): 5-6. doi:10.1099/ijs.0.000005-0.
- ^ a b Sayers. “Bdellovibrionota”. アメリカ国立生物工学情報センター (National Center for Biotechnology Information：NCBI). 2016年3月20日閲覧。
- ^ Jurkevitch, E. (2007). “Predatory behaviors in bacteria—Diversity and transitions”. American Society for Microbiology: 67-72.
- ^ Martin W. Hahn, Johanna Schmidt, Ulrike Koll, Manfred Rohde, Susanne Verbarg, Alexandra Pitt, Ryosuke Nakai, Takeshi Naganuma, Elke Lang (01 August 2017). “Silvanigrella aquatica gen. nov., sp. nov., isolated from a freshwater lake, description of Silvanigrellaceae fam. nov. and Silvanigrellales ord. nov., reclassification of the order Bdellovibrionales in the class Oligoflexia, reclassification of the families Bacteriovoracaceae and Halobacteriovoraceae in the new order Bacteriovoracales ord. nov., and reclassification of the family Pseudobacteriovoracaceae in the order Oligoflexales”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (8). doi:10.1099/ijsem.0.001965.
- ^ “Phylum Bdellovibrionota”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). 2016年3月20日閲覧。
- ^ “The LTP”. All-Species Living Tree Project. 23 February 2021閲覧。
- ^ “LTP_all tree in newick format”. 23 February 2021閲覧。
- ^ “LTP_12_2021 Release Notes”. 23 February 2021閲覧。
- ^ “GTDB release 07-RS207”. Genome Taxonomy Database. 20 June 2022閲覧。
- ^ “ar53_r207.sp_label”. Genome Taxonomy Database. 20 June 2022閲覧。
- ^ “Taxon History”. Genome Taxonomy Database. 20 June 2022閲覧。