フィーカリバクテリウム属
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| 分類 | ||||||||||||||||||
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| 学名 | ||||||||||||||||||
| Faecalibacterium Duncan et al., 2002[1] (IJSEMリストに掲載 2003[2]) | ||||||||||||||||||
| タイプ種 | ||||||||||||||||||
| フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ Faecalibacterium prausnitzii (Hauduroy et al. 1937[3]) Duncan et al. 2002[1] (IJSEMリストに掲載 2003[2]) | ||||||||||||||||||
| 下位分類（種）[9] | ||||||||||||||||||
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フィーカリバクテリウム属（Faecalibacterium）は真正細菌のバシロタ門クロストリジウム綱ユーバクテリウム目オシロスピラ科の属の一つである。
解説
[編集]2002年にタイプ種であるフィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Faecalibacterium prausnitzii）が報告され、この属が新設された。この種はグラム陽性[10]、中温性、桿状細胞[11]、嫌気性[12]であり、人間の腸内細菌叢において最も多く重要な共生細菌の一つである。非胞子形成性で非運動性である[13]。この細菌は、食物繊維の発酵を通じて酪酸といった短鎖脂肪酸を生成する。
歴史
[編集]2002年に、フソバクテリウム・プラウスニッツィイ（Fusobacterium prausnitzii）が実はフソバクテリウム属（Fusobacterium）とは遠縁であり、クロストリジウム属クラスターIVにより近いことが系統発生学的解析によって明らかとなったため、フィーカリバクテリウム属が新設され、この種はフィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイ（Faecalibacterium prausnitzii）に再分類された。属名はドイツの微生物学者カール・プラウスニッツ（Otto Prausnitz）に因んで名づけらえた[14]。
2021年に、Faecalibacterium butyricigeneransとFaecalibacterium longumが発見されたことが報告された[4]。
2022年に、Faecalibacterium duncaniae、Faecalibacterium hattorii及びFaecalibacterium gallinarumが発見されたことが報告された[6]。
遺伝学
[編集]フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイのゲノムサイズは2,868,932 bpであり、GC含量は56.9%である。77種のRNAをコードする遺伝子を含む2,707個のコード配列が発見されている[15]。128種の代謝経路、27種のタンパク質複合体、64種のtRNAも確認されている。系統学的に系統群I及びIIに含まれる。2012年にM. Tanweer Khanによって分離された株のほとんどは系統群IIに属する[16]。この細菌によって産生されるタンパク質は抗炎症効果に関連する[17]。
臨床学
[編集]健康な成人では、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイは腸内細菌の5%以上を占め、最も一般的な腸内細菌の一つである[18]。抗炎症作用を示し、腸内細菌叢の不均衡（dysbiosis）を改善する可能性がある。フィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイの腸内レベルが正常より低くなることはクローン病や肥満、気管支喘息、大うつ病性障害（MDD）と関連し[19][20][21][22]、高くなることは乾癬と関連する[23]。この細菌はまた腸のバリア機能を改善する可能性がある[24]。
炎症性腸疾患(IBD)
[編集]クローン病について、2015 年現在、ほとんどの研究（1件の例外を除く）[25]で患者の糞便及び粘膜サンプルの両方においてフィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイのレベルの低下が見られた[26]。但し、酸素に弱く、直腸へ送るためには取り扱いが難しい[26]。
クローン病の寛解導入効果が知られている排他的経腸栄養(Exclusive enteral nutrition：EEN)は、患者のフィーカリバクテリウム・プラウスニッツィイを減少させることが発見されている[27]。
脚注
[編集]- ^ a b c Sylvia H Duncan, Georgina L Hold, Hermie J M Harmsen, Colin S Stewart, Harry J Flint (01 November 2002). “Growth requirements and fermentation products of Fusobacterium prausnitzii, and a proposal to reclassify it as Faecalibacterium prausnitzii gen. nov., comb. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52 (6): 2141-2146. doi:10.1099/00207713-52-6-2141. PMID 12508881.
- ^ a b c “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 52, part 6, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 (2): 375-376. (01 March 2003). doi:10.1099/ijs.0.02704-0.
- ^ a b Hauduroy P, Ehringer G, Urbain G, Guillot G, Magrou J (1937). Dictionnaire des bactéries pathogènes. Masson et Cie (仏パリ)
- ^ a b c Yuanqiang Zou, Xiaoqian Lin, Wenbin Xue, Li Tuo, Ming-Sheng Chen, Xiao-Hui Chen, Cheng-hang Sun, Feina Li, Shao-wei Liu, Ying Dai, Karsten Kristiansen & Liang Xiao (31 May 2021). “Characterization and description of Faecalibacterium butyricigenerans sp. nov. and F. longum sp. nov., isolated from human faeces”. Scientific Reports 11 (1): 11340. doi:10.1038/s41598-021-90786-3. PMC 8166934. PMID 34059761.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 December 2021). “Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (11): 5096. doi:10.1099/ijsem.0.005096.
- ^ a b c d Mitsuo Sakamoto, Naomi Sakurai, Hiroki Tanno, Takao Iino, Moriya Ohkuma, Akihito Endo (13 April 2022). “Genome-based, phenotypic and chemotaxonomic classification of Faecalibacterium strains: proposal of three novel species Faecalibacterium duncaniae sp. nov., Faecalibacterium hattorii sp. nov. and Faecalibacterium gallinarum sp. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (4): 5379. doi:10.1099/ijsem.0.005379. PMID 35416766.
- ^ a b c Aharon Oren, George M. Garrity (29 July 2022). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 72, part 4 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (7): 5434. doi:10.1099/ijsem.0.005434.
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 October 2021). “Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (9): 4943. doi:10.1099/ijsem.0.004943.
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