ハプログループX (mtDNA)

ハプログループX (mtDNA)（ハプログループX (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup X (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち「N」を祖先に持ち73, 7028, 11719, 12705, 14766, 16189, 16223, 16278の変異で定義されるグループである^[1]。

分布

ハプログループXはヨーロッパ人、中東人およびアメリカ先住民^[2]で観察され、とくにアルゴンキン語族話者に多く見られる^[3]^[4]が、その分布は謎に満ちている。アメリカ大陸では北米大陸のみに観察され、東部ほど高頻度であることから、ヨーロッパからの直接移住があったのではないかという説がある。これに関連してソレトリュー仮説（英語版）が存在する^[5]が、立証されていない。もっともアルタイ地域においてハプログループXがわずかに観察されるため^[6]、シベリア経由でアメリカ大陸にやってきたという説も存在するが、アルタイ地域のタイプはヨーロッパに分布するタイプの下位分岐であり、5000年前にヨーロッパ・中東方面からもたらされたという^[7]（シベリアからアメリカへ人類が移住したのは10000年以上前であるから、それよりもずっと後のことである。）。アメリカ大陸に分布するのはX2aという下位系統で、アメリカ固有のものである^[8]。分岐年代は不明であるが、アルゴンキン語族の拡散と関連して、過去のある時期（コロンブスがアメリカ大陸に到達する1492年よりもっと前）においてヨーロッパからアメリカ大陸への直接移住が存在した可能性も否定できない。しかし、ワシントン州から発掘された8690–8400年前の人骨「Kennewick Man」はハプログループX2aに属しており^[9]、この時期までに北アメリカ西岸にX2aが到達していたことを示しており、他のハプログループとともにベーリンジアを越えてやってきた可能性もある^[10]。

下位系統

系統樹^[11]^[12]

X
- X4: アルメニア
- (153)
  - X1 (146): 北アフリカ、中東
    - (15654)
      - X1a: 北アフリカ、中東
      - X1c: スペイン、チュニジア
      - (152, 153): エチオピア
    - X1b (o X3): モロッコ、ポルトガル、ドルーズ
  - X2 (195, 1719): ユーラシア西部、北アメリカ、中央アジア、シベリア
    - X2f: ジョージア、アルメニア、ドルーズ、リビア、トルコ、タジキスタン
    - (225)
      - X2a'j (12397): 北アメリカ、イラン、シベリア（ポドカメンナヤ・ツングースカ川流域）^[11]
        X2a (200, 8913, 14502, 16213): 北米先住民（オジブワ、スー族、ナバホなど^[13]）
        X2a1: 五大湖周辺
        X2a1a: スー族など
        
        X2a1b: オジブワ
        
        X2a1c: オジブワ
        
        X2a2: ナバホ
        
        X2j (16179, 16357): アイルランド、エジプト
      - X2b: オークニー諸島、東欧、南欧、北アフリカ、中東、エベンキ^[11]
      - X2c: バルト海沿岸、コーカサス、中央アジア、アルバニア
      - (153!)
        X2d: ヨーロッパ、中東、コーカサス
        
        X2g: オジブワ^[14]
      - X2e
        X2e1: ギリシャ人、クルド人
        
        X2e2: シベリア南部（アルタイ人、ブリヤート人、テレンギト人）、タジク人、ヨーロッパ、コーカサス、中東
      - X2h: ドルーズ^[15]

ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの系統樹

ミトコンドリア・イブ (L)

L0

L1

L5

L2

L6

L4

L3

M

N

M7

M8

M9

D

G

Q

N1

N2

N9

A

O

S

X

R

M7a

C

Z

E

I

W

Y

R0

R9

B

JT

P

U

HV

F

J

T

K

H

V

脚注

^ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. Retrieved 2009-05-20.
^ "Dolan DNA Learning Center – Native American haplogroups: European lineage, Douglas Wallace". Dnalc.org. Retrieved 2011-01-28.
^ "The peopling of the Americas: Genetic ancestry influences health". Scientific American.
^ "Learn about Y-DNA Haplogroup Q" (Verbal tutorial possible). Wendy Tymchuk – Senior Technical Editor. Genebase Systems. 2008. Retrieved 2009-11-21.
^ The North Atlantic ice-edge corridor: a possible Palaeolithic route to the New World. Bruce Bradley and Dennis Stanford. World Archaeology 2004 Vol. 36(4):459–478. http://planet.uwc.ac.za/nisl/Conservation%20Biology/Karen%20PDF/Clovis/Bradley%20&%20Stanford%202004.pdf Archived 2013年3月20日, at the Wayback Machine.
^ Derenko MV, Grzybowski T, Malyarchuk BA, Czarny J, Miścicka-Sliwka D, Zakharov IA (July 2001). "The presence of mitochondrial haplogroup x in Altaians from South Siberia". Am. J. Hum. Genet. 69 (1): 237–241. doi:10.1086/321266. PMC 1226041. PMID 11410843.
^ Reidla M, Kivisild T, Metspalu E et al. (November 2003). "Origin and diffusion of mtDNA haplogroup X". Am. J. Hum. Genet. 73 (5): 1178–1190. doi:10.1086/379380. PMC 1180497. PMID 14574647.
^ Reidla, Meira; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Kaldma, Katrin; Tambets, Kristiina; Tolk, Helle-Viivi; Parik, Jüri; Loogväli, Eva-Liis et al. (November 2003). "Origin and Diffusion of mtDNA Haplogroup X". Am. J. Hum. Genet. (The American Society of Human Genetics) 73 (5): 1178–90. doi:10.1086/379380. PMC 1180497. PMID 14574647. "It is apparent that the Native American haplogroup X mtDNAs derive from X2 by a unique combination of five mutations. It is notable that X2 includes the two complete Native American X sequences that constitute the distinctive X2a clade, a clade that lacks close relatives in the entire Old World, including Siberia. The position of X2a in the phylogenetic tree suggests an early split from the other X2 clades, likely at the very beginning of their expansion and spread from the Near East northeast of the Altai area, haplogroup X sequences were detected in the Tungusic-speaking Evenks, of the Podkamennaya Tunguska basin (Central Siberia). In contrast to the Altaians, the Evenks did not harbor any West Eurasian mtDNA haplogroups other than X. However, neither of the two Evenk X haplotypes showed mutations characteristic of the Native American clade X2a. Instead, one sequence was a member of X2b and the other of X2. Thus, one possible scenario is that several X haplotypes arrived in Siberia from western Asia during the Palaeolithic, but only X2a crossed Beringia and survived in modern Native Americans."
^ M. Rasmussen, M. Sikora, A. Albrechtsen, T. S. Korneliussen, J. V.Moreno-Mayar, G. D. Poznik, C. P. Zollikofer, M. S. Ponce de León, M. E. Allentoft, I. Moltke, H. Jónsson, C. Valdiosera, R. S. Malhi, L. Orlando, C. D. Bustamante, T. W. Stafford Jr., D. J. Meltzer, R. Nielsen, E. Willerslev. “The ancestry and affiliations of Kennewick Man.” Nature (2015).
^ Jennifer A. Raff & Deborah A. Bolnick (2015) Does Mitochondrial Haplogroup X Indicate Ancient Trans-Atlantic Migration to the Americas? A Critical Re-Evaluation, PaleoAmerica,1:4, 297-304, DOI:10.1179/2055556315Z.00000000040
^ ^a ^b ^c Reidla, Maere; T. Kivisild; E. Metspalu, et al. (2003). Origin and diffusion of mtDNA haplogroup X. American Journal of Human Genetics 73 (5): 1178–1190.
^ Ian Logan's DNA Site
^ Fagundes, N. et al (2008). «Mitochondrial Population Genomics Supports a Single Pre-Clovis Origin with a Coastal Route for the Peopling of the Americas» (pdf). American Journal of Human Genetics 82 (3): 583-592. Consultado el 19 de noviembre de 2009.
^ Perego U. et al 2009. Distinctive Paleo-Indian Migration Routes from Beringia Marked by Two Rare mtDNA Haplogroups. Current Biology, Volume 19, Issue 1, 13 January 2009, Pages 1-8
^ Shluss L. et al 2008, The Druze: A Population Genetic Refugium of the Near East. PLoS ONE 3(5): e2105. doi:10.1371/journal.pone.0002105

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[1] van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. Retrieved 2009-05-20.

[2] "Dolan DNA Learning Center – Native American haplogroups: European lineage, Douglas Wallace". Dnalc.org. Retrieved 2011-01-28.

[3] "The peopling of the Americas: Genetic ancestry influences health". Scientific American.

[4] "Learn about Y-DNA Haplogroup Q" (Verbal tutorial possible). Wendy Tymchuk – Senior Technical Editor. Genebase Systems. 2008. Retrieved 2009-11-21.

[5] The North Atlantic ice-edge corridor: a possible Palaeolithic route to the New World. Bruce Bradley and Dennis Stanford. World Archaeology 2004 Vol. 36(4):459–478. http://planet.uwc.ac.za/nisl/Conservation%20Biology/Karen%20PDF/Clovis/Bradley%20&%20Stanford%202004.pdf Archived 2013年3月20日, at the Wayback Machine.

[6] Derenko MV, Grzybowski T, Malyarchuk BA, Czarny J, Miścicka-Sliwka D, Zakharov IA (July 2001). "The presence of mitochondrial haplogroup x in Altaians from South Siberia". Am. J. Hum. Genet. 69 (1): 237–241. doi:10.1086/321266. PMC 1226041. PMID 11410843.

[7] Reidla M, Kivisild T, Metspalu E et al. (November 2003). "Origin and diffusion of mtDNA haplogroup X". Am. J. Hum. Genet. 73 (5): 1178–1190. doi:10.1086/379380. PMC 1180497. PMID 14574647.

[8] Reidla, Meira; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Kaldma, Katrin; Tambets, Kristiina; Tolk, Helle-Viivi; Parik, Jüri; Loogväli, Eva-Liis et al. (November 2003). "Origin and Diffusion of mtDNA Haplogroup X". Am. J. Hum. Genet. (The American Society of Human Genetics) 73 (5): 1178–90. doi:10.1086/379380. PMC 1180497. PMID 14574647. "It is apparent that the Native American haplogroup X mtDNAs derive from X2 by a unique combination of five mutations. It is notable that X2 includes the two complete Native American X sequences that constitute the distinctive X2a clade, a clade that lacks close relatives in the entire Old World, including Siberia. The position of X2a in the phylogenetic tree suggests an early split from the other X2 clades, likely at the very beginning of their expansion and spread from the Near East northeast of the Altai area, haplogroup X sequences were detected in the Tungusic-speaking Evenks, of the Podkamennaya Tunguska basin (Central Siberia). In contrast to the Altaians, the Evenks did not harbor any West Eurasian mtDNA haplogroups other than X. However, neither of the two Evenk X haplotypes showed mutations characteristic of the Native American clade X2a. Instead, one sequence was a member of X2b and the other of X2. Thus, one possible scenario is that several X haplotypes arrived in Siberia from western Asia during the Palaeolithic, but only X2a crossed Beringia and survived in modern Native Americans."

[9] M. Rasmussen, M. Sikora, A. Albrechtsen, T. S. Korneliussen, J. V.Moreno-Mayar, G. D. Poznik, C. P. Zollikofer, M. S. Ponce de León, M. E. Allentoft, I. Moltke, H. Jónsson, C. Valdiosera, R. S. Malhi, L. Orlando, C. D. Bustamante, T. W. Stafford Jr., D. J. Meltzer, R. Nielsen, E. Willerslev. “The ancestry and affiliations of Kennewick Man.” Nature (2015).

[10] Jennifer A. Raff & Deborah A. Bolnick (2015) Does Mitochondrial Haplogroup X Indicate Ancient Trans-Atlantic Migration to the Americas? A Critical Re-Evaluation, PaleoAmerica,1:4, 297-304, DOI:10.1179/2055556315Z.00000000040

[Reidla-11] Reidla, Maere; T. Kivisild; E. Metspalu, et al. (2003). Origin and diffusion of mtDNA haplogroup X. American Journal of Human Genetics 73 (5): 1178–1190.

[12] Ian Logan's DNA Site

[13] Fagundes, N. et al (2008). «Mitochondrial Population Genomics Supports a Single Pre-Clovis Origin with a Coastal Route for the Peopling of the Americas» (pdf). American Journal of Human Genetics 82 (3): 583-592. Consultado el 19 de noviembre de 2009.

[14] Perego U. et al 2009. Distinctive Paleo-Indian Migration Routes from Beringia Marked by Two Rare mtDNA Haplogroups. Current Biology, Volume 19, Issue 1, 13 January 2009, Pages 1-8

[15] Shluss L. et al 2008, The Druze: A Population Genetic Refugium of the Near East. PLoS ONE 3(5): e2105. doi:10.1371/journal.pone.0002105

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