テッラバクテリア
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| 分類 | ||||||
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| 学名 | ||||||
| "Terrabacteria"(Battistuzzi et al., 2004) | ||||||
| 下位分類（門） | ||||||
テッラバクテリア（Terrabacteria）とは、細菌ドメインにおいて提唱されている系統群である。グラム陽性菌や光合成細菌などを含む大きな系統であり、上門相当とされることがある[1]。2004年に藍色細菌門、デイノコックス・テルムス門、放線菌門を含む系統として提唱され[2]、後にクロロフレクサス門やフィルミクテス門、そのほかの近縁系統が追加された[3]。実在するとすれば6000以上の種を含む[3]。これは記載されている細菌の2/3を超える。いくつかの分子系統解析がこの系統の実在を支持している[1][4]。細菌ドメイン内で、グラシリクテス（ハイドロバクテリアとも）とともに細菌の大部分を占める[3][5]。CPR群はテッラバクテリアに含まれる可能性がある[5]。
外膜の無い細菌類のほぼ全てを含んでいる。起源は大陸の発達した30億年前に遡ると想定されている。地球史における陸地の発達と関連すると考えられ、乾燥、紫外線、高塩環境への適応に優れている。海中での占有率は12-14%だが、湿った土壌では28%、乾燥土壌では67%を占める[3]。そのためラテン語で大陸・陸地を意味するTerra（テッラ）+bacteriaでTerrabacteriaと名付けられた[2]。
特徴
[編集]- （外膜無、胞子○、光合成△、グラム陽性）フィルミクテス門
- （外膜無、胞子×、光合成×、グラム陰性）テネリクテス門
- （外膜無、胞子○、光合成×、グラム陽性）放線菌門
- （外膜有、胞子○、光合成○、グラム陰性）藍色細菌門
- （外膜有、胞子×、光合成×、グラム陽性/陰性）デイノコックス・テルムス門
- （外膜無、胞子○、光合成△、グラム陰性/陽性）クロロフレクサス門
細胞壁の構造
[編集]放線菌とフィルミクテス門、テネリクテス門は従来から外膜が無いとされてきた。また、クロロフレクサス門も細胞壁にリポ多糖が無く、構造的に類似している。外膜を欠損するのはテッラバクテリアに固有の形質であり、その他の細菌は全て外膜を保有している。なお、藍色細菌門とデイノコックス・テルムス門には外膜がある。
フィルミクテス門と放線菌、デイノコックス・テルムス門の多くの種はグラム陽性であり、また、クロロフレクサス門にも多くのグラム陽性菌が所属している。テッラバクテリア意外にグラム陽性の細菌はほとんどいない。
胞子
[編集]フィルミクテス門の多くの種は内性胞子を形成する。また、放線菌のうち、ストレプトマイセス属、マイコバクテリウム属の一部の種、藍色細菌のプレウロカプサ目が内性胞子を形成する。また、放線菌の多くの種は分節胞子を、クロロフレクサス門のクテドノバクテリア綱も出芽胞子を形成する特徴がある。一方、テッラバクテリア以外の細菌で胞子に類似の構造を形成するのはクラミジア門やプロテオバクテリアのごく一部の種に限定される。
系統（Battistuzzi et al., 2009による）
[編集]テルモトガ、アクウィフェクス、フソバクテリアの位置付けは今日でも定まっていないことに注意。
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また、メタゲノムデータなどの蓄積により、テッラバクテリアに含まれるとされる細菌の種類は現在にいたるまで増加している。例えば以下のグループは現在テッラバクテリアに分類されている。
- メライナバクテリア（Melainabacteria）
- セリサイトクロマティア（Sericytochromatia）
- マーギュリスバクテリア（Margulisbacteria）
- サガンバクテリア（Saganbacteria）
- ドルミバクテリウム（Dormibacteraeota）
- エレミオバクテリウム（Eremiobacteraeota）
- アルマティモナス（Armatimonadetes）
- アブディティバクテリウム（Abditibacteriota）
- マイコプラズマ（Mycoplasmatota）（テネリクテス）
脚注
[編集]- ^ a b Rinke, C., Schwientek, P., Sczyrba, A., et al. (2013)“Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter,”Nature, 499(7459):431-7.
- ^ a b Battistuzzi, F. U., A. Feijão, and S. B. Hedges. 2004. A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land. BMC Evol. Biol. 4:44.
- ^ a b c d Battistuzzi FU, Hedges SB (February 2009). "A major clade of prokaryotes with ancient adaptations to life on land". Mol. Biol. Evol. 26 (2): 335–43.
- ^ Bern M, Goldberg D (2005). "Automatic selection of representative proteins for bacterial phylogeny". BMC Evol. Biol. 5 (1): 34.
- ^ a b Coleman, Gareth A.; Davín, Adrián A.; Mahendrarajah, Tara A.; Szánthó, Lénárd L.; Spang, Anja; Hugenholtz, Philip; Szöllősi, Gergely J.; Williams, Tom A. (2021-05-07). “A rooted phylogeny resolves early bacterial evolution” (英語). Science 372 (6542): eabe0511. doi:10.1126/science.abe0511. ISSN 0036-8075.
- ^ ただし、rRNAによる系統樹ではテッラバクテリアに入らない（Battistuzzi et al., 2009）
- ^ フソバクテリアの位置は不確定（Battistuzzi et al., 2009）
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