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ストレプトスポランジウム目

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』
ストレプトスポランジウム目
分類
ドメイン : 真性細菌
Bacteria
門 : 放線菌門
Actinomycetota
綱 : 放線菌綱
Actinomycetes
目 : ストレプトスポランジウム目
Streptosporangiales
学名
Streptosporangiales
Goodfellow 2015[1]
(IJSEMリストに記載 2015[2])
タイプ属
ストレプトスポランジウム属
Streptosporangium
Couch 1955[3]
(IJSEMリストに記載 1980[4])
下位分類（科）[13]

ストレプトスポランジウム目（Streptosporangiales）は真正細菌の放線菌門放線菌綱の目の一つである。

概要

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好気性のグラム陽性菌である。気菌糸上に胞子の鎖又は小胞を形成する。細胞壁ペプチドグリカンはメソジアミノピメリン酸を含む。リン脂質プロファイルはPIV型で、ホスファチジルエタノールアミンを持つ場合と持たない場合があり、どちらの場合でもグルコサミンを含む[14]。一部の菌株は好熱菌である[15]。

16S rRNAのヌクレオチド配列におけるシグネチャーパターンは127:234(A–U)、829:857(G–C)、830:856(G–C)、953:1228(U–A)、950:1231(U–A)、955:1225(C–G)、986:1219(A–U)、及び987:1218(A–U)である[16]。

歴史

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  • 1997年に、ストレプトスポランジウム目の前身となるストレプトスポランジウム亜目（Streptosporangineae）は、ストレプトスポランジウム科（Streptosporangiaceae）とノカルディオプシス科（Nocardiopsidaceae）、サーモモノスポラ科（Thermomonosporaceae）の3科で構成された、放線菌綱の分類項目としてStackebrandtらにより提案された[9]。
  • 2009年に、Zhiらによって、放線菌綱の16S rRNA遺伝子の解析が行われ、ストレプトスポランジウム亜目の16S rRNAのシグネチャーパターンの情報の更新が行われた[16]。
  • 2015年にストレプトスポランジウム目は提案された[1]。
  • 2018年に、放線菌門のゲノムシーケンシングが行われ、ストレプトスポランジウム目の分類体系上の位置が系統発生学的に裏付けられた[15]。
  • 2020年に新科としてTreboniaceaeが提案された[11]。

系統樹

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現在、広く認められた分類体系はList of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)に従っている。下記の系統樹は全ゲノム解析の結果に基づく[15][注釈 1]。

 
ストレプトスポランジウム目（Streptosporangiales）
 
 

Allonocardiopsis

 
 

ノカルディオプシス科(Nocardiopsidaceae)

 
 
 
 

サーモモノスポラ科(Thermomonosporaceae)

 
 

ストレプトスポランジウム科(Streptosporangiaceae)

 
 
 
外群

ストレプトマイセス目(Streptomycetales)

 
 

注釈

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  1. ^ Treboniaceaeはこの系統樹に含まれていない。

脚注

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  1. ^ a b Goodfellow M (2012). “Order XV. Streptosporangiales ord. nov.”. In Michael Goodfellow, Peter Kämpfer, Hans-Jürgen Busse, Martha E. Trujillo, Ken-ichiro Suzuki, Wolfgang Ludwig, William B. Whitman. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 5: The Actinobacteria. Springer (New York). pp. 1805. doi:10.1007/978-0-387-68233-4 
  2. ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 July 2015). “List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_7): 2017-2025. doi:10.1099/ijs.0.000317. 
  3. ^ Couch JN (1955). “A new genus and family of the Actinomycetales, with a revision of the genus Actinoplanes”. Journal of Elisha Mitchell Scientific Society 71: 148-155. 
  4. ^ V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225. 
  5. ^ Fred A. Rainey, Naomi Ward－Rainey, Reiner M. Kroppenstedt, Erko Stackebrandt (01 October 1996). “The Genus Nocardiopsis Represents a Phylogenetically Coherent Taxon and a Distinct Actinomycete Lineage: Proposal of Nocardiopsaceae fam. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 46 (4): 1088-92. doi:10.1099/00207713-46-4-1088. PMID 8863440. 
  6. ^ “Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 46, No. 4, of the IJSBa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (1): 243-244. (01 January 1997). doi:10.1099/00207713-47-1-243. 
  7. ^ M. Goodfellow, L. J. Stanton, K. E. Simpson, D. E. Minnikin (01 January 1990). “Numerical and chemical classification of Actinoplanes and some related actinomycetes”. Microbiology Society 136 (1): 19-36. doi:10.1099/00221287-136-1-19. 
  8. ^ “Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 40 (3): 320-321. (01 July 1990). doi:10.1099/00207713-40-3-320. 
  9. ^ a b Erko Stackebrandt, Fred A. Rainey, Naomi L. Ward-Rainey (01 January 1997). “Proposal for a New Hierarchic Classification System, Actinobacteria classis nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (2): 479-491. doi:10.1099/00207713-47-2-479. 
  10. ^ “Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 47, No. 2, of the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (3): 917-919. (01 July 1997). doi:10.1099/00207713-47-3-917. 
  11. ^ a b Daria Rapoport, Marketa Sagova-Mareckova, Ivo Sedláček, Jan Provaznik, Stanislava Králová, Dinko Pavlinic, Vladimir Benes, Jan Kopecky (17 August 2020). “Trebonia kvetii gen. nov., sp. nov., an acidophilic actinobacterium, and proposal of the new actinobacterial family Treboniaceae fam. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (9): 5106-5114. doi:10.1099/ijsem.0.004388. PMID 32804604. 
  12. ^ Aharon Oren, George M. Garrity (21 December 2020). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 70, part 9 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (12): 6021-6023. doi:10.1099/ijsem.0.004529. 
  13. ^ “Order Streptosporangiales”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年2月26日閲覧。
  14. ^ Goodfellow M. (17 April 2015). “Streptosporangiaceae”. Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. John Wiley & Sons, Inc. doi:10.1002/9781118960608. ISBN 9781118960608 
  15. ^ a b c “Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria”. Front. Microbiol. 9: 2007. (2018). doi:10.3389/fmicb.2018.02007. PMC 6113628. PMID 30186281. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6113628/. 
  16. ^ a b Xiao-Yang Zhi, Wen-Jun Li, Erko Stackebrandt (01 March 2009). “An update of the structure and 16S rRNA gene sequence-based definition of higher ranks of the class Actinobacteria, with the proposal of two new suborders and four new families and emended descriptions of the existing higher taxa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59 (3). doi:10.1099/ijs.0.65780-0. 
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