コリバクチン

コリバクチン
	IUPAC名 2-[6-[(2S)-2-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrol-5-yl]-5-oxo-4-azaspiro[2.4]hept-6-en-7-yl]-N-[[4-[2-[4-[2-[[2-[6-[(2S)-2-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrol-5-yl]-5-oxo-4-azaspiro[2.4]hept-6-en-7-yl]acetyl]amino]acetyl]-1,3-thiazol-2-yl]-2-oxoacetyl]-1,3-thiazol-2-yl]methyl]acetamide
識別情報
PubChem	138805674
ChEBI	CHEBI:156303;
	SMILES C[C@H]1CCC(=N1)C2=C(C3(CC3)NC2=O)CC(=O)NCC4=NC(=CS4)C(=O)C(=O)C5=NC(=CS5)C(=O)CNC(=O)CC6=C(C(=O)NC67CC7)C8=N[C@H](CC8)C;
	InChI InChI=1S/C37H38N8O7S2/c1-17-3-5-21(40-17)29-19(36(7-8-36)44-33(29)51)11-26(47)38-13-25(46)23-15-54-35(43-23)32(50)31(49)24-16-53-28(42-24)14-39-27(48)12-20-30(22-6-4-18(2)41-22)34(52)45-37(20)9-10-37/h15-18H,3-14H2,1-2H3,(H,38,47)(H,39,48)(H,44,51)(H,45,52)/t17-,18-/m0/s1 Key: ZWKHDAZPVITMAI-ROUUACIJSA-N;
特性
化学式	C37H38N8O7S2
モル質量	770.88 g mol−1
	特記なき場合、データは常温 (25 °C)・常圧 (100 kPa) におけるものである。

コリバクチン（colibactin）は、大腸菌（Escherichia coli）やその他の腸内細菌によって生産される遺伝毒性代謝物である。遺伝子変異を引き起こして、大腸がんの原因となると考えられている^[1]^[2]^[3]^[4]。コリバクチンはポリケチドペプチドであり、DNAにおいて鎖間架橋（英語版）を形成できる^[2]。コリバクチンはポリケチド合成酵素（英語版）ゲノムアイランド（英語版）（pks）^[1]またはclb生合成遺伝子クラスター（英語版）^[4]を含む細菌株によってのみ生産される。ヒトのおよそ20%にpksアイランドをかくまっている大腸菌が定着している^[5]。

コリバクチンは、相対するDNA鎖上のアデニン部分のアルキル化によってDNA鎖間架橋を形成する^[4]。プロファージを含む特定のバクテリアでは溶解発育（lytic development）を誘導する^[6]。

出典

^ ^a ^b Arthur JC (2020). “Microbiota and colorectal cancer: colibactin makes its mark”. Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology 17 (6): 317–318. doi:10.1038/s41575-020-0303-y. PMID 32317778.
^ ^a ^b Zhou T, Hirayama Y, Watanabe K (2021). “Isolation of New Colibactin Metabolites from Wild-Type Escherichia coli and In Situ Trapping of a Mature Colibactin Derivative”. Journal of the American Chemical Society 143 (14): 5526–5533. doi:10.1021/jacs.1c01495. PMID 33787233.
^ Helmink BA, Khan M, Wargo JA (2019). “The microbiome, cancer, and cancer therapy”. Nature Medicine 25 (3): 377–388. doi:10.1038/s41591-019-0377-7. PMID 30842679.
^ ^a ^b ^c Wernke KM, Xue M, Herzon SB (2020). “Structure and bioactivity of colibactin”. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 30 (15): 127280. doi:10.1016/j.bmcl.2020.127280. PMC 7309967. PMID 32527463.
^ Balskus EP (2015). “Colibactin: understanding an elusive gut bacterial genotoxin”. Natural Product Reports 32 (11): 1534–40. doi:10.1039/c5np00091b. PMID 26390983.
^ Silpe, Justin E.; Wong, Joel W. H.; Owen, Siân V.; Baym, Michael; Balskus, Emily P. (2022-02-23). “The bacterial toxin colibactin triggers prophage induction” (英語). Nature: 1–6. doi:10.1038/s41586-022-04444-3. ISSN 1476-4687.