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構造類似タンパク質ファミリーのデータベース

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
FSSPデータベースから転送)

構造類似タンパク質ファミリーのデータベース: Families of Structurally Similar ProteinsFSSP)は、距離マトリクスアライメント(: Distance-matrix ALIgnment、DALI)アルゴリズムを使用して作成された、構造的に重畳したタンパク質データベースである[1]。このデータベースは、タンパク質の構造を比較するのに役立つ。

参照項目

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  • CATH - タンパク質ドメインの進化的関係に関する情報のデータベース
  • SCOP - タンパク質の構造ドメインを分類したデータベース

脚注

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  1. ^ Holm L, Ouzounis C, Sander C, Tuparev G, Vriend G (1992). “A database of protein structure families with common folding motifs”. Protein Science 1 (12): 1691–1698. doi:10.1002/pro.5560011217. PMC 2142138. PMID 1304898. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2142138/. 

外部リンク

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